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很快，朱棣便选了七人入职文渊阁。分别是杨士奇、杨荣、解缙、黄淮、胡广、金幼孜、胡俨。这七位辅臣参预机务，帮助皇帝处理政事，明朝内阁制度由此开始。另外，杨溥、胡濙等人也得到了朱棣的重用。
杨寓，字士奇，江西泰和人，建文年间因修撰《明太祖实录》被选入翰林，任编纂官，朱棣赏识杨士奇才学，加之姚广孝的力荐，被任为翰林院编修，选入文渊阁。
杨荣，字勉仁，建安人，因提醒朱棣谒皇陵而得到朱棣的青睐，进其为翰林院侍讲，选入文渊阁。
杨溥，字弘济，湖广石首人，好诗书，有才学，也得朱棣赏识，进而得到重用。
因杨士奇、杨荣、杨溥这三人都姓杨，皆负大才，又同为朱棣重臣，故称“三杨”，根据籍贯，杨士奇被称作“西杨”；杨荣被称作“东杨”；杨溥被称作“南杨”。
而解缙更是名满天下的大才子，朱棣的即位诏书便是解缙草拟，入选文渊阁后，解缙成了朱棣最信任的宠臣。
胡濙本为建文二年的进士，朱棣将其升任户科都给事中。
这些得到朱棣重用的官员大多都是在洪武、建文时期怀才不遇，而朱棣夺位后便来迎附的，朱棣便重用了这些下层朝臣，他们皆为朱棣亲手提拔，便自然对他甚为忠心。
朱棣在任命七位辅臣入阁之后，特在右顺门召见了杨士奇、杨荣、解缙、黄淮、胡广、金幼孜、胡俨这七人，七位辅臣受宠若惊，只听朱棣说道：“你们七人最为勤慎，朝夕侍朕左右，你们定要尽心竭力，朕望你们待朕之心长久，朕愿与君等共勉。”七人听后纷纷跪倒在地，齐声说道：“陛下不以臣等浅陋，如此信任臣等，臣等必尽心竭力以报皇恩。”
七位入职文渊阁的辅臣虽然品级不高，只是正七品，但是由于旦夕侍奉在皇帝身边，且参与机务，待遇上与六部尚书无异，因而权势极大。
徐令仪见朱棣设置了内阁，为了给夫君分忧，便在柔仪殿隆重接见了这七位辅臣的妻子，按照明朝的规矩，一品、二品大员的妻子受封“夫人”，三品官员的妻子受封“淑人”，四品官员的妻子受封“恭人”，五品官员的妻子受封“宜人”，六品官员的妻子受封“安人”七品官员的妻子只是“孺人”。能入宫朝拜皇后的必须是“夫人”或“淑人”，七位辅臣的妻子虽被称为“夫人”，可级别只是“孺人”，是绝对没有可能朝见皇后的。而皇后徐令仪却主动接见了七位辅臣妻子，并将夫人的冠服赐给了这七位辅臣妻子，七位辅臣妻子自然是无上荣耀。
徐令仪与七位辅臣妻子相聊甚欢，聊到尽兴之处，令仪对七位辅臣妻子说道：“咱们做妻子的侍奉丈夫，可不只是照顾好他们的饮食起居而已，朋友之言，有从有违，而夫妇之言，则婉顺易入。本宫旦夕侍奉陛下，惟以生民为念，本宫也望诸位姐妹与本宫共勉，侍奉我们各自的夫君，将这大明的江山社稷治理得如汉唐一般。”徐令仪如此做便是为了让那七位辅臣侍奉朱棣更尽心，果然，在以后的二十几年中，朱棣亲手提携的心腹始终尽心于他，帮助朱棣缔造了远迈汉唐的永乐盛世。
待送走了七位辅臣的妻子，还有一件事情让徐令仪坐卧不安，那便是立储之事。朱棣登上皇位之后，封赏功臣、晋封后妃，可唯独没有立太子。朱高炽为嫡长子，是太祖皇帝朱元璋亲封的燕王世子，按理来说就应受封皇太子，而朱棣对于立储之事迟迟不提，众人自然都看得出来，朱棣是有意立次子朱高煦为太子。
徐令仪对自己的儿子最是了解，她深知高煦泼皮无赖、心狠手辣，虽是难得的勇将，却绝非治国之才，若高煦登上皇位，不但高炽一家性命难保，就是这大明江山也将不知会成为什么样子。而高炽仁厚多才，日后若是他登上皇位，则高煦一家性命可保，且大明必定国富民强。
于是徐令仪来到隐能寺专程拜访姚广孝。姚广孝见徐皇后前来，忙施礼问安，“皇后娘娘屈尊来此，真是折煞微臣了。”徐令仪赶忙说道：“先生不必拘礼，陛下能有天下，先生乃是第一功臣。”“皇后娘娘抬举微臣了，陛下雄才伟略，文武兼备，能荣登大宝乃是天命所归，臣只是追随陛下而已。”徐令仪笑笑，“本宫知道先生乃天下第一聪明之人，居功而不自傲，乃是保全自己。”“皇后娘娘不愧为‘女诸生’，虽为女子，却如在世诸葛。”“先生抬举本宫了。先生才为在世诸葛。本宫今日前来有一事相求。”“臣知道皇后娘娘乃是为立储一事前来。”“先生真乃神机妙算。”姚广孝走上前来，又向徐令仪施了一礼，“皇后娘娘，自古‘飞鸟尽、良弓藏；狡兔死，走狗烹’的道理从未变过。请娘娘饶臣一命，臣只在寺中吃斋念佛，为的便是保命。若臣参与到立储一事当中，日后必定死无葬身之地。当然立储一事乃国之大计，臣为皇后娘娘荐上一人，只要有此人在，不但大皇子能继承大统，且大明江山定能昌若汉唐。”徐令仪急忙问道：“先生可是说大才子解缙？”姚广孝神秘一笑，“解缙身负大才、名满天下，且是忠正为民之臣，自会在立储之事上有莫大之功。可臣所说之人并非解缙。”徐令仪万分好奇，“那是何人？”姚广孝正色答道：“翰林院编修，杨士奇。”徐令仪沉默了一会，说道：“先生之言定然错不了。”姚广孝又露出一丝微笑，“只要有此人在，娘娘便可放心。陛下已置内阁，擢七位辅臣与陛下参预机务。娘娘如今要做的，便是助杨士奇当上内阁首辅。”徐令仪点点头，“本宫谢过先生了。”
徐令仪谢别了姚广孝，径直回了坤宁宫，借召高炽、若兰、瞻基共同进膳为由将姚广孝的话告诉了高炽夫妇。紧接着，在徐令仪、姚广孝的帮助下，杨士奇成为了内阁首辅，杨荣成为了内阁次辅。
有了自己的辅臣，朱棣便开始了对大明帝国的治理。朱棣召来了七位辅臣商议迁都之事。他们用免缴税赋的优厚条件，将直隶苏州等十郡、浙江等九省富民迁徙北京，大量的外来移民中，农民在北京地区垦荒种地，商人在北京地区经营生意，北京人口逐年增多。与此同时，朱棣下令疏通京杭大运河，畅通了南北漕运，南北经济交往也随着大运河的疏通而得到加强。
这日夜里，令仪伏在床边读书，陶菊走上前来，“皇后娘娘，陛下睡下了。”令仪放下手中的书，“还是听着辅臣的奏事入睡的？”“正是，陛下每日四鼓便起，清晨便去奉天门常朝，直至午膳才散朝。进过午膳，陛下便召来近臣们商议国事。用过晚膳，陛下还要批阅奏疏，直至深夜，陛下困乏至极，便躺在乾清宫的龙床上，值宿的辅臣便坐在龙床边与陛下议事。陛下经常与辅臣说着说着，便困得睡着了。听马煜说，陛下梦中都是国事，经常夜里惊醒。陛下日日如此，除非，哪日陛下临幸妃嫔，夜里还能早些安睡。可是陛下登基以来，很少临幸妃嫔的。张贵妃自荣国公战死沙场，便日日吃斋念佛，陛下登基后，张贵妃更是在未央宫中日日礼佛，甚少出门。这后宫当中，也就王贵妃一枝独秀。”令仪点点头，“清瑶妹妹思怀生父，日日礼佛，甚少出门。放眼望去这后宫当中，最得圣意的便是玉竹了。陛下不易，既然玉竹妹妹能让陛下开怀，多去她长乐宫总是好的。”